Ryokan i Tokyo erbjuder en unik möjlighet att uppleva japansk tradition mitt i den moderna metropolen. Dessa pensionat i japansk stil ligger främst i historiska Asakusa och närheten av Ikebukuro, och erbjuder rum med tatamimattor, futonsängar och shoji-skärmar. Här kan du räkna med delade badutrymmen, ibland med cypressbadkar, och enkla gemensamma utrymmen som takterrasser och launderetter. Priserna varierar beroende på standard och läge, men generellt sett är ryokan ett prisvärt alternativ för den som prioriterar autenticitet över lyx.
Bland de högst rankade ryokan i Tokyo märks Ryokan Asakusa Shigetsu, beläget fem minuters promenad från Senso-ji-templet och med utsikt över Tokyo Skytree från sitt hinoki-bad. Andon Ryokan, med utmärkt arkitektur, ligger 20 minuters promenad från Asakusa och har takterrass, gratis internetstation och uthyrning av cyklar. Kimi Ryokan, 600 meter från JR Ikebukuro-stationen, är helt rökfritt och har ett cypressbad, gemensamt kök och enkel tillgång till tunnelbanan. För den som vill ha närhet till shopping och nöjen är Ikebukuro och Asakusa utmärkta baser, med direktförbindelser till Ueno, Shinjuku och Shibuya.